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T4 多聚核苷酸激酶(3磷酸酶活性缺失)

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T4多聚核苷酸激酶能夠催化ATP的 γ-位磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移到寡核苷酸鏈(雙鏈或單鏈DNA或RNA)的 5’-羥基末端以及3’-單磷酸核苷上。T4 多聚核苷酸激酶還具有3’磷酸酶活性,將3’-磷酸基團(tuán)從寡核苷酸的3’磷酸末端、脫氧3’-單磷酸核苷和脫氧3’-二磷酸核苷上水解掉。該酶經(jīng)修飾后,其3’磷酸酶活性缺失,但仍保留了所有激酶的活性。

組分

組分名稱(chēng) 數(shù)量
T4 Polynucleotide Kinase (10 U/μl) 20 μl/200 μl
10×T4 PNK Buffer 1 ml/1 ml×2
10mM ATP 100 μl/500 μl

應(yīng)用

  • DNA 或 RNA 5´ 末端的磷酸化,以便進(jìn)行連接反應(yīng)。
  • DNA 或 RNA 的末端標(biāo)記,用作探針和進(jìn)行 DNA 測(cè)序
  • 將 3´ 端已經(jīng)磷酸化的單核苷酸 5´ 磷酸化,制備pNp 底物,用于添加到 DNA 或 RNA的 3´ 端
  • 對(duì) 3´ 端有磷酸基團(tuán)的寡核苷酸的 5´ 端進(jìn)行標(biāo)記

活性定義

1 單位指 37℃條件下,30 分鐘內(nèi)催化1nmol 酸不溶性[32P] 摻入所需要的酶量。

儲(chǔ)存

-20℃可保存3年。

使用注意事項(xiàng)

(1)1× T4 多聚核苷酸激酶反應(yīng)緩沖液:70 mM Tris-HCl pH 7.6,10 mM MgCl2,5 mM DTT,37℃ 溫育。
(2)熱失活:65℃ 加熱 20 分鐘。
(3)在放射性標(biāo)記實(shí)驗(yàn)中,可用 1× T4 多聚核苷酸激酶反應(yīng)緩沖液、50pmol的γ-[32P] ATP和20單位的酶37℃溫育30分鐘。
(4)T4多聚核苷酸激酶需要ATP才能發(fā)揮活性,但是為了適用于高活力的放射性標(biāo)記反應(yīng),在隨酶提供的反應(yīng)緩沖液中不含ATP。因此在磷酸化修飾核酸時(shí)請(qǐng)單獨(dú)添加終濃度0.5~1mM ATP。
(5)要提高平齊末端或5’凹陷末端的磷酸化效率,可在加入T4多聚核苷酸激酶前,先將DNA溶液于70℃加熱5分鐘,然后冰上冷卻,并加入5%(W/V)的PEG-8000。
(6)一般來(lái)說(shuō),進(jìn)行激酶反應(yīng)之后是連接反應(yīng)。在這種情況下,T4多聚核苷酸激酶反應(yīng)在連接酶反應(yīng)緩沖液中37℃ 溫育30分鐘即可。反應(yīng)后的產(chǎn)物可直接進(jìn)行連接,無(wú)需改變緩沖液和進(jìn)行熱失活。如果連接時(shí)需要保持其它DNA片段的去磷酸化狀態(tài),則需要在連接反應(yīng)前熱失活T4多聚核苷酸激酶。
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